水土保持工程科山坡地水土保持管理與宣導、土石流潛勢溪流防治與坡地防災管理，山坡地邊坡崩塌防治、野溪疏通、水土保持處理、維護工程、濱海沙灘、沙洲緊急復育工程之施工、管理及履約督導等事項。
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雨水下水道工程科辦理本市東、南、中西、北、安平、安南、仁德等7區之水利工程業務；業務內容為水利新建工程、改善工程、維護工程、疏濬清淤工程，移動式抽水機與簡易抽水之設置、管理維護及雨水下水道工程等之設計、監造、訂約、施工履約管理、緊急搶修、復建、工程用地取得及拆遷補償等事項。 水門抽水站管理科區域排水、雨水下水道抽水站與水門之管理維護、抽水站及水門之設備汰舊換新工程，新設抽水站及水門機電設備工程等事項。 污水新建工程科污水下水道系統建設計畫之擬訂、審核、規劃、設計；污水下水道工程之規劃、新建、增建、施工、管理；污水下水道法規之訂定、技術之研究發展、工程用地取得及拆遷補償等事項；污水管線維護與搶修管理綜合業務；水資源回收中心放流水回收再利用計畫。 污水養護工程科污水下水道設施營運、操作、維護管理、改善與水質檢驗、分析、統計與報告，專用下水道審查、污水下水道用戶排水設備接管申請、審核，用戶接管之使用管理、稽查，各項資訊系統之建立、分析及管理等事項、自行車道建置、綠美化及維管、竹溪親水綠廊營造計畫、運河底泥改善計畫、污泥再利用計畫、安平再生水利用計畫。 |