稽查檢驗科
公害陳情案件稽查、報案中心、公害糾紛、環境檢驗、監測、裁決。
服務電話：
報案中心6572916#2222、2226、稽查業務6572916＃2202、2231、2243、裁決業務6572916＃2203、2251～2257
一般廢棄物管理科
資源回收、巨大廢棄物及廚餘多元再利用、裝潢廢棄物再利用、垃圾強制分類、源頭減量、資源回收(焚化)廠、掩埋場、滲出水處理廠、灣裡水肥廠及營運管理。
服務電話：2686751#1667、1617
清淨家園管理科
一般廢棄物清運、溝渠疏濬、環境消毒、道路清掃、空地空屋、公廁、海岸淨灘、違規小廣告、病媒蚊孳生源等環境衛生管理事項、違反廢棄物清理法檢舉獎勵、清淨家園全民運動。
服務電話：06-2686660#9各區清潔隊服務電話
服務項目：垃圾清運、資源回收、廚餘回收、巨大垃圾清運聯繫
| 東區 2900322 |
後壁區 6336305 |
學甲區 7831059 |
玉井區 5749471 |
| 中西安平區 3912221 |
東山區 6801307 |
新化區 5905541 |
楠西區 5752699 |
| 南區 2963004 |
麻豆區 5716877 |
善化區 5814128 |
南化區 5773429 |
| 北區 3841101 |
下營區 6792141 |
官田區 5795490 |
左鎮區 5732890
|
| 安南區 3841813 |
佳里區 7224514 |
大內區 5764414 |
永康區 2547110 |
| 新營區 6526646 |
西港區 7961537 |
六甲區 5795697 |
仁德區 2706722 |
| 鹽水區 6524368 |
七股區 7874100 |
新市區 5998934 |
歸仁區 2304064 |
| 柳營區 6220558 |
將軍區 7946393 |
安定區 5813583 |
關廟區 5955800 |
| 白河區 6853340 |
北門區 7862397 |
山上區 5782269 |
龍崎區 5940351 |